中国同南共体及其大多数成员国（除斯威士兰为未建交国外）保持着良好的合作关系。中国驻博茨瓦纳大使兼任驻南共体代表。中国邀请南共体以观察员身份出席了中非合作论坛历次部长会和高官会，并多次参加南共体与国际合作伙伴的部长级磋商会议。2004年南共体执行秘书拉姆萨米访华。2005年8月，南共体举行第25次首脑会议暨成立25周年庆祝活动，温家宝总理致电祝贺。2005年11月，黄菊副总理访问博茨瓦纳期间会见了南共体执行秘书萨洛芒。2006年11月，南共体执行秘书萨洛芒来华出席中非合作论坛第三届部长级会议。2011年3月，中国与南共体在哈博罗内举行首次政治磋商。6月，纳米比亚总统波汉巴以南共体轮值主席身份访华。2015年12月，南共体代表出席中非合作论坛约翰内斯堡峰会暨第6届部长级会议。2018年9月，南共体执行秘书塔克斯作为观察员来华列席中非合作论坛北京峰会开幕式和论坛第七届部长级会议。
2022年，中国同南共体国家贸易总额为1037.4亿美元，占中非贸易额的36.8％。
2008年5月中国四川汶川发生特大地震灾害后，南共体驻华使团向灾区捐款10万元人民币。2010年4月青海玉树地震后，南共体执行秘书萨洛芒致信我驻博茨瓦纳大使兼驻南共体代表刘焕兴表示慰问，南共体成员国驻华使节并向灾区捐款3万元人民币。同年6月，南共体外交妇女协会向儿童希望基金会、特奥天使艺术团、爱心蓝天等中国数家慈善机机构捐赠35万元人民币善款。
2016年，南共体轮值主席、博茨瓦纳总统卡马宣布南部非洲地区遭受严重旱灾，并代表南共体向国际社会求援。中国向部分受灾严重的南共体国家提供了紧急粮食援助。
2020年，中国暴发新冠肺炎疫情后，南共体执行秘书塔克斯致函中方表示慰问。
2021年，王毅国务委员兼外长向新任南共体执行秘书马戈西致就职贺电。
2024年9月，南共体执行秘书马戈西应邀作为观察员出席中非合作论坛北京峰会暨第九届部长级会议。
