上海合作组织（简称“上合组织”）成员国元首理事会是上合组织最高机构，每年举行一次例会，就组织内所有重大问题作出决定和指示。
2001年6月15日，上合组织成员国元首理事会首次会议在中国上海举行。会上，六国元首签署了《上海合作组织成立宣言》，宣告上合组织正式成立。
2002年6月7日，元首理事会第二次会议在俄罗斯圣彼得堡举行。六国元首签署《上海合作组织宪章》《关于地区反恐怖机构的协定》《上海合作组织成员国元首宣言》等三个重要文件，为上合组织的机制化和法律化建设奠定了基础。
2007年8月16日，元首理事会第七次会议在吉尔吉斯斯坦首都比什凯克举行。六国元首签署了《上海合作组织成员国长期睦邻友好合作条约》，把成员国人民“世代友好、永保和平”的思想以法律形式确定下来。
2024年7月4日，上海合作组织成员国元首理事会第二十四次会议在哈萨克斯坦阿斯塔纳举行。习近平主席出席会议并发表题为《携手构建更加美好的上合组织家园》的重要讲话，强调上合组织国家要牢固树立命运共同体意识，始终秉持“上海精神”，坚定不移走契合本国国情、符合本地区实际的发展道路，倡导“五个共同家园”建设，即团结互信、和平安宁、繁荣发展、睦邻友好、公平正义的上合组织共同家园。会议期间，习近平主席同与会各国领导人就共同关心的国际和地区问题深入交换意见，为上合组织下步发展擘画了蓝图、描绘了前景，达成了系列共识。成员国领导人签署并发表《上海合作组织成员国元首理事会阿斯塔纳宣言》，批准上海合作组织关于各国团结共促世界公正、和睦、发展的倡议、关于完善上海合作组织运作机制的建议，发表关于睦邻互信和伙伴关系原则的声明以及涉及能源、投资、信息安全等领域合作的一系列决议。会议正式批准白俄罗斯加入上海合作组织，决定由中国接任2024-2025年度上海合作组织轮值主席国。
