2020年6月30日，中国和巴基斯坦应对新冠肺炎疫情联防联控合作机制正式成立并举行首次视频会议。机制旨在落实中巴两国领导人重要共识，加强双方沟通协调，统筹开展联防联控，稳步有序恢复双边人员往来和经贸合作，推动两国关系在疫情防控常态化背景下保持良好发展势头。
机制由两国外交部牵头，卫生、教育、海关、国际发展合作、移民、民航等部门参加。中国外交部亚洲司副司长姚文和巴基斯坦外交部中国司司长提普共同主持首次视频会议。双方积极评价疫情发生以来中巴坚定相互支持和密切合作，探讨了下步联防联控重点方向和具体措施。双方商定，将根据需要不定期举行机制会议。
